在朱镕基同志的親自倡導(dǎo)和大力推動下，上海國家會計學(xué)院于2000年9月正式組建。學(xué)院是財政部直屬事業(yè)單位，由財政部和上海市人民政府雙重領(lǐng)導(dǎo)，實行黨委領(lǐng)導(dǎo)下的院長負(fù)責(zé)制。學(xué)院還是中國政府倡導(dǎo)設(shè)立的亞太財經(jīng)與發(fā)展學(xué)院（AFDI）所在地，該學(xué)院是中國政府在APEC框架下倡導(dǎo)建立的第一個旨在促進(jìn)區(qū)域能力建設(shè)的機構(gòu)。

　　十多年來，在財政部的直接領(lǐng)導(dǎo)下，在各級領(lǐng)導(dǎo)的關(guān)懷和指導(dǎo)下，在社會各界的大力支持下，上海國家會計學(xué)院歷經(jīng)艱苦創(chuàng)業(yè)，積極探索高級財金、會計人才教育規(guī)律，適應(yīng)經(jīng)濟社會發(fā)展對高端人才的需求和會計行業(yè)發(fā)展戰(zhàn)略，面向國家宏觀經(jīng)濟部門、國有大中型企業(yè)、金融機構(gòu)和中介機構(gòu)等開展高層次繼續(xù)教育，形成了清晰的辦學(xué)思路、辦學(xué)模式。逐步形成了學(xué)位教育、高層管理培訓(xùn)、遠(yuǎn)程教育“三足鼎立”的事業(yè)格局，在經(jīng)濟社會領(lǐng)域形成了較高的知名度，被譽為會計人員的“精神家園”。